QS世界大学排名是一个广受欢迎的学科领域的世界一流大学的综合指南。利用声誉研究引证数据，排名突出200个世界顶级大学30个别科目。2015QS世界大学排名中日本大学有10所大学进入TOP200榜单中，日本东京大学排名有所提升，由2014年QS中32名升至31名。
| 1 | The University of Tokyo | 东京大学 |
| 2 | Kyoto University | 京都大学 |
| 3 | Osaka University | 大阪大学 |
| 4 | Tokyo Institute of Technology | 东京科技学院 |
| 5 | Tohoku University | 东北大学 |
| 6 | Nagoya University | 名古屋大学 |
| 7 | Kyushu University | 九州大学 |
| 8 | Hokkaido University | 北海道大学 |
| 9 | Keio University | 奎夫大学 |
| 10 | University of Tsukuba | 筑波大学 |
| 11 | Waseda University | 早稻田大学 |
| 12 | Kobe University | 神户大学 |
| 13 | Tokyo Medical and Dental University | 东京医科牙科大学 |
| 14 | Hiroshima University | 广岛大学 |
| 15 | Tokyo Metropolitan University | 东京首都大学 |
| 16 | Chiba University | 千叶大学 |
| 17 | Kanazawa University | 金沢大学 |
| 18 | Okayama University | 冈山大学 |
| 19 | Yokohama City University | 横滨城市大学 |
| 20 | Nagasaki University | 长崎大学 |
| 21 | Kumamoto University | 熊本大学 |
| 22 | Osaka City University | 大阪市立大学 |
| 23 | Tokyo University of Agriculture and Technology | 东京农业科技大学 |
| 24 | Tokyo University of Science | 东京理工大学 |
| 25 | Gifu University | 岐阜大学 |
| 26 | Gunma University | 群马大学 |
| 27 | Niigata University | 日本新舄大学 |
| 28 | Osaka Prefecture University | 日本大阪府立大学 |
| 29 | Yokohama National University | 横滨国立大学 |
| 30 | Aoyama Gakuin University | 青山大学 |
| 31 | Doshisha University | 同志度大学 |
| 32 | Kagoshima University | 鹿儿岛大学 |
| 33 | Ochanomizu University | 御茶水女子大学 |
| 34 | Ritsumeikan University | 立命馆大学 |
| 35 | Saitama University | 埼玉大学 |
| 36 | Shinshu University | 信州大学 |
| 37 | Tokai University | 东海大学 |
| 38 | Yamaguchi University | 山口大学 |
| 39 | Hitotsubashi University | 一桥大学 |
